Bioloogilise mikroskoobi suurendus on tavaliselt väike, ulatudes 40x kuni 1000x. Seda seetõttu, et bioloogilised proovid on tavaliselt läbipaistvad ja vajavad rakkude ja kudede struktuuride jälgimiseks mõõdukat suurendust.
Bioloogilises mikroskoobis määrab suurenduse objektiivi ja okulaari kombinatsioon. Tavaliste objektiivide suurenduste hulka kuuluvad 4x, 10x, 40x ja 100x, samas kui okulaari suurendus on tavaliselt 10x. Seetõttu on tüüpilise bioloogilise mikroskoobi maksimaalne suurendus 100x objektiiv korrutatuna 10x okulaariga, mis võrdub 1000x.
Oluline on märkida, et bioloogilise mikroskoobi suurendus ei ole nii suur kui elektronmikroskoobi oma, kuna bioloogilised proovid on sageli keeruka struktuuriga ning vaatlusprotsess nõuab proovide elujõulisuse ja terviklikkuse säilitamist. Lisaks on ülioluline ka bioloogilise mikroskoobi eraldusvõime, kuna bioloogilised struktuurid on sageli väga väikesed ja vajavad peente detailide jälgimiseks kõrget eraldusvõimet.
Teatud spetsiaalsetes rakendustes, mis nõuavad suuremat suurendust, nagu patoloogilised uuringud või mikrokirurgia, võib suurema suurenduse saavutamiseks kasutada suurema suurendusega okulaari (nt 16x või rohkem) koos sobivate okulaaridega. Need suure suurendusega vaatlused nõuavad aga tavaliselt keerukamaid proovide ettevalmistamise ja mikroskoopia tehnikaid ning nõuavad operaatorilt suuremaid oskusi.